混乱中，幼主被救下。
杨武疯狂破坏太庙，最终被乱箭射杀。
清理太庙时，他们发现了尘的最终计划，他要在月蚀之夜，通过太庙的祭天仪式，将孢子散播天下。
而杨武，不过是个被利用的棋子。
月蚀之夜平安度过。
但陆丞心中不安越发强烈，了尘如此大费周章，真的这么容易就被阻止了吗？
三日后，边关急报。
各地出现新型疯病，患者不再狂暴，反而变得极其顺从，如同提线木偶。
“了尘改良了孢子。”
陆丞骇然，“他要的不是混乱，是绝对控制！”
更可怕的是，患者脑后都出现半月印记，与毒印相似，却更加深入骨髓。
调查发现，这些人都饮用过新开的惠民井的水。
井水检测出改良孢子成分。
顺藤摸瓜，发现这些井都是一个叫善水教的组织所挖。
教主号称活佛转世，普度众生。
陆丞立即调查善水教。
教主是个面带慈悲的老僧，见到陆丞也不惊慌。
“施主何必执着？”老僧微笑道：“百姓安居乐业，天下太平，不好吗？”
陆丞冷声道：“用药物控制得来的太平，是虚假的太平！”
老僧叹息：“虚假的太平也好过真实的乱世。
看看如今百姓，不再有争斗，不再有痛苦。”
突然，陆丞注意到老僧手腕的半月烙印，与了尘的一模一样！
“你也是月组织的人？”
老僧大笑：“月组织？
不，我们早已超越那个名字，我们是新’，是真正的救世主。”
他按下机关，地面裂开，露出地下巨大工厂，无数被控制的百姓如行尸走肉般工作，生产更多的孢子！
“了尘师父的遗志，由我继承。”老僧狂热道，
“很快，全世界都将获得幸福！”
陆丞与之激战，老僧服用特制孢子，变得刀枪不入。
最终陆丞发现其弱点在后脑的印记处，才将其制服。
工厂被捣毁，但孢子已扩散至周边州县。
更糟糕的是，研究发现这种改良孢子会通过接触传染！
疫情以惊人速度蔓延，朝廷不得不封锁整个地区，设立隔离区。
隔离区内，陆丞见到骇人景象。
被感染者如同温顺的羔羊，整齐划一地工作、生活，却没有丝毫自我意识。
“这才是了尘真正的目的。”陆丞也是感觉一阵头发发麻，忍不住喃喃自语，“消灭人性，创造绝对服从的傀儡世界！。”
研究发现，解药对改良孢子无效。
唯一办法是找到母体孢子，了尘最初研发的那批。
根据老僧交代，母体孢子藏在了尘的故乡，江南一个小镇。
陆丞立即南下。
在了尘故居，他发现个惊人秘密。
了尘原本是个善良医师，因家人全部死于瘟疫，才变得偏激，想要消除世间所有痛苦。
母体孢子就藏在故居地窖，但地窖机关需要了尘的血脉才能打开。
“了尘还有后人？”陆丞震惊，他对了尘也算是了解，那种人怎么可能有后人呢？
可是这是事实，那就只有亲自去看一看了。
调查发现，了尘确实有个女儿，早年出家为尼。
陆丞立即赶往庵堂。
见到那位法号“净尘”的师太时。
陆丞愣在原地，她竟与洛神有七分相似。
净尘坦然承认身份，却拒绝帮忙：“父亲走错了路，我不能再助纣为虐。”
但当她看到疫情报告中的惨状后，
终于落泪：“父亲，你终究变成了自己最憎恶的人。”
她提供血液打开地窖，里面不仅有母体孢子，还有了尘的手记。
日记最后一页写着：“当我完成这一切，或许就能明白，当年那些放任瘟疫的官员，是怎样的心情。”
原来了尘的家人并非死于天灾，而是人祸当地官员隐瞒疫情，导致瘟疫扩散。
了尘一生都在对抗这种冷漠，最终却成了更可怕的存在。
取得母体孢子，太医终于研制出新解药。
疫情渐渐控制。
但净尘的话让陆丞深思：“父亲的错误在于想要消除所有痛苦，但痛苦本就是人性的一部分。”
返京后，陆丞奏请幼主改革医政，建立疫情通报制度，避免类似悲剧。
幼主准奏，却忧心忡忡道：“月组织虽灭，但其理念仍在。
只要世间还有痛苦，就会有人想走这条捷径。”
陆丞望向窗外新月：“所以我们更要让百姓明白，真正的幸福不是没有痛苦，而是战胜痛苦。”
然而暗流从未停止，三个月后，海边渔村传来消息。
有渔民捞到个青铜箱子，里面装着月见魔兰的种子！
陆丞立即赶往处理。
回京时，收到幼主密信：“太傅，朕发现个有趣的现象—每次月组织覆灭，总会在别处发现新的种子。
仿佛永远清除不尽。”
陆丞回信内容也很简单：“月光永恒，阴影长存。我们能做的，就是永远守望。”
只是最后他在奏折最后添上一句：“正如月有阴晴圆缺，人心善恶亦如此。
重要的是，永远选择光明。”